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1.科研神器-数据提取软件WebPlotDigitizer的相关操作

今天向大家推荐一款在撰写论文时非常实用的数据提取软件——WebPlotDigitizer。在查阅文献时，我们经常会遇到图表中只有图形没有具体数据的情况。为了进一步分析，我们需要获取图表的原始数据，然后自行绘图进行验证。这款软件完全免费，能够满足我们的需求。接下来，我将为大家演示整个操作过程。软件运行下载地址请查看文末，下载压缩包后无需安装，直接解压主程序即可。软件运行界面如下软件具体操作步骤1. 导入要提取数据图片，点击软件右下方的Load Image，选择图片进行导入

2. 选择相应的图表类型，这里选择2D(x,y)Plot，然后点击Align Axes按钮

3. 按顺序放置4个已知点，两个位于X轴 (X1, X2)，两个位于Y轴 (Y1, Y2)。通常选择X和Y的最小值与最大值。点击Proceed进行最大最小点的选取，选完之后点击Complete

4. 填写X和Y的范围，按照实际情况填写。如果是对数坐标系，则需勾选对应坐标轴之后的对数刻度对话框

5. 设置曲线颜色和背景颜色，方便软件进行数据点的自动提取。在软件右侧的Automatic Extraction的Mask列表中，设置对应的曲线颜色和背景颜色。设置曲线颜色设置背景颜色6. 设置完颜色后，点击Automatic Extraction的Pen按钮，调节工具大小，将要提取数据的曲线包裹起来，设置点的分布密度，点击Run按钮即可提取曲线数据点

7. 提取完成的数据点如图所示，可以在右侧工具栏进行数据点的相关编辑，如增加点、删除点、调整点的位置

8. 点击左侧的View data查看数据，设置数据格式并进行数据保存。9. 提取完成一条曲线的数据后，用同样的操作提取另一条曲线数据，并导入Excel进行绘图，绘制完成后与原图进行对比。Excel绘制结果原图10. 结束可以看到，绘制结果几乎与原图一模一样。至此，我们的工作已经全部完成。希望这个教程能帮到你。11. 软件地址百度网盘链接: pan.baidu.com/s/1GxE1OE... 提取码: 52pj阿里云盘链接：aliyundrive.com/s/ysPC4...项目github地址：github.com/ankitrohatgi...

2.软件推荐(5)——使用WebPlotDigitizer抠取文献数据

在撰写论文或实验报告时，常需引用其他学者的性能数据，此时抠图提取原始数据成为一项重要技能。抠图原理基于笛卡尔坐标系：图像中数据点与坐标轴的距离与数值差成正比，对数坐标系中关系为乘方。常见的抠图软件包括Origin自带的图像数字化模块、Matlab编写的Haocurve、Getdata以及WebPlotDigitizer。WebPlotDigitizer推荐的主要优势在于其便捷性和多功能性。下载软件时，直接通过百度搜索WebPlotDigitizer即可。官网提供在线版本，支持中文切换，若需离线使用，下载对应系统版本即可。在进行抠图前，先保存截图。不同软件的截图快捷键如下：Windows为Win+Shift+S，微信为Alt+A，QQ为Ctrl+Alt+A。我使用的是前文提到的Quicker进行截图，自动保存至指定位置。以下以Seebeck系数数据为例，演示抠图步骤。导入图片后，选择图片类型（通常为二维XY图），通过在图上选择四个点确定坐标范围，输入对应的刻度值。对数坐标时，务必勾选Log scale选项。在抠点时，可根据颜色实现自动化操作。首先，利用box或pen工具选择数据区域，调整笔划宽度。设定前景（数据）颜色和背景颜色，背景默认白色，取色器在图上获取数据点颜色，调整颜色容差，进行颜色筛选。根据颜色抠点后，点击右下角的Run按钮进行自动抠点。通过调整两点间的最小横纵距离改变抠点密度。在Adjust Point模式下，使用方向键对点进行微调，Shift+方向键进行粗调，Q/W选择上一个/下一个点。通过右上角的放大区域查看点的位置。抠取

3.蛋白-蛋白作用分析so easy - Ligplot+

Ligplot+是一款用于蛋白蛋白作用分析的软件，它能够分析氨基酸间的相互作用，包括氢键与疏水作用，适用于复合物与单个分子内部的作用分析。以下是关于Ligplot+的详尽介绍：功能特点：分析氨基酸间相互作用：Ligplot+能够详尽分析蛋白蛋白复合物中氨基酸之间的相互作用，特别是氢键和疏水作用，这对于理解蛋白质的功能和相互作用机制至关重要。适用于不同分析场景：该软件既适用于复合物中不同链之间的相互作用分析，也适用于单个分子内部氨基酸间的作用分析，提供了灵活多样的分析手段。获取与安装：学术免费下载：Ligplot+官网提供学术免费下载服务，期限一年，过期后可申请续用。软件通过邮件发放，方便用户获取。安装要求：在安装Ligplot+之前，需确保电脑已安装Java，因为该软件依赖于Java运行环境。下载压缩包后，解压并放置于指定的目录。软件使用：设置临时目录：双击打开Ligplot+后，需进入【Edit】【program path】设置【Temporary directory】为C:/tmp，并确保在C盘下创建tmp文件夹。如已安装pymol，可填写其路径，以便在需要时调用。打开PDB文件：通过【File】【Open】【pdb file】选择并打开PDB文件。在进行复合物分析时，需选择相应的链；在进行单个分子内部作用分析时，可通过右侧选择特定链的氨基酸。运行分析与保存结果：运行分析后，可通过【Edit】【Size definitions】自定义显示参数，如字体、原子大小、键宽等。将分析结果保存为特定格式的文件，并使用Photoshop等软件打开并转换为所需的图片格式。学习资源：视频教程：Ligplot+的使用教程视频已发布在B站，用户可参考学习，以便更快地掌握软件的使用方法和技巧。综上所述，Ligplot+是一款功能强盛且易于使用的蛋白蛋白作用分析软件，它能够帮助研究人员深入理解和分析蛋白质间的相互作用机制。

4.Phreeqc||软件使用教程和资源

PHREEQC是一款用于模拟水溶液中化学物质反应和传输的专业软件，广泛应用于地理、水化学、环境科学、海洋工程等领域，尤其适合绘制“优势区图”（Predominance diagram）。以下是PHREEQC软件的使用教程和资源推荐：

一、软件下载与版本选择官网下载：官网地址：https://www.hydrochemistry.eu/下载地址：https://www.hydrochemistry.eu/ph3/index.html版本推荐：PhreePlot和Phreeqc Interactive（USGS）是较为稳固且功能完善的版本，适合大多数用户。其他版本可能存在兼容性问题，不建议初学者使用。

二、快速绘图工具如果仅需绘制优势区图，无需深入学习软件操作，可访问以下网址：http://www.phreeplot.org/gal_main_new.html进入后选择Predominance plot - Grid approach，即可看到示例界面。获取代码：在示例界面中，选择感兴趣的图表（如As的优势区图），单击图表即可显示生成该图的所有代码。

三、学习资源推荐中文教程：推送中附有详尽的中文教程，内容全面，适合初学者快速上手。官方示例：官方提供了丰腴的示例文件，可通过以下链接访问：https://www.hydrochemistry.eu/exmpls/index.html建议充分研究官方示例，掌握软件的基本操作和高级功能。视频教程：Hatari Labs制作了PHREE

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